گسترش دانش و فناوری در زمینه پزشکی مولکولی، مهندسی ژنتیک و DNA نوترکیب روز به روز حوزه های جدیدی را فراروی محققان قرار می دهد. در این میان ابزار و فناوری جدید شاه کلید گشایش روزنه های امید در حل مشکلات دنیای پزشکی امروز محسوب می شوند. فناوری های پزشکی مولکولی با رویکرد پایه و بالینی جایگاه ویژه ای درحوزه های تشخیصی و درمانی دارند. در این راستا آزمایشگاه مرکز تحقیقات گوارش و کبد مرکز آموزشی پژوهشی درمانی فیروزگر با در اختیار داشتن برترین و به روز ترین تجهیزات در زمینه تشخیص مولکولی آمادگی و  قابلیت انجام هرگونه طرح تحقیقاتی در این زمینه را  دارا می باشد.
از جمله خدمات عمومی بخش مولکولی این مرکز می توان به موارد ذیل اشاره کرد:
•    طراحی ، بررسی ویژگی و اختصاصیت پرایمر
•    استخراج DNA و RNA
•    تعیین غلظت ، خلوص و یکپارچگی اسید نوکلئیک استخراج شده
•    انجام تکنیک های PCR :
•    Real Time -PCR کیفی و کمی
•    RT - PCR
•    Nasted - PCR
•    PCR - RFLP
•    الکتروفورز بر پایه ی ژل آگاروز
•    تصویر برداری  از ژل توسط Gel Doc
از جمله دستگاه های موجود بخش مولکولی این مرکز می توان به موارد ذیل اشاره کرد:
•    Real-Time PCR step one plus  ABI
•    Thermocycler ABI
•    Gel documentation
•    تانک الکتروفورز
•    فریز آزمایشگاهی -80  درجه
•    فریز آزمایشگاهی -40درجه
•    فریز آزمایشگاهی  -20درجه (2 عدد)
•    یخچال (2 عدد)
•    سانتریفیوژ (2 عدد)
•    ترازو دیجیتال
•    ورتکس
•    Vortex-Spinner
•    ترازو دیجیتال
•    هود بیولوژیک
•    هود لامینار